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我们假设他真的写过两首古典风格的长诗《维纳斯和阿多尼斯》和《鲁克丽丝受辱记》，那么，他到伦敦之后，是否真的写过那些相当受欢迎的成功的戏剧作品呢？事实上，有些作品所依据的故事原型那时并没有翻译成英文，如《雅典的泰门》和《奥瑟罗》。这些剧作中的故事，均取自古希腊和古罗马的历史，如果剧作者没有受过相应的教育，就像威廉·莎士比亚一样，恐怕写不出这样的戏剧作品。
历史剧还包括《亨利四世》，故事主要围绕某个历史事件展开。但这些主题却不是伊丽莎白时期观众的兴趣所在。剧中小丑约翰·福斯塔夫的滑稽可笑弥补了一切。观众都喜爱这个人物，女王也喜爱这个人物。伊丽莎白女王很有可能在1596年的圣诞节前后观看了《亨利四世》的上篇。她对约翰·福斯塔夫这个胖乎乎的骑士非常着迷，她跟自己的表兄亨兹顿贵族说，她想看到一出老恶棍陷入爱情的戏剧。亨兹顿是弗朗西斯的资助人之一，于是，他很快就联系上了“莎士比亚”。“莎士比亚”随即开始创作，以满足女王陛下的要求。《温莎的风流娘儿们》就是在这种背景下催生出来的。
批评家们都认为，《温莎的风流娘儿们》创作时间不超过三个星期。整个剧情没有任何严肃内容，也是莎士比亚36部剧作中惟一一部不涉及贵族题材的剧作。它主要写中下阶层人群的故事。弗朗西斯显然尽了全力，以使该剧的主调听起来很像威廉·莎士比亚这样的人所写的东西。他使用的语言淫猥但还算得体，他使全剧充满女王喜欢的那种喜剧精神。
据我们所知，女王看了这出剧，喜出望外。不过，她也有点心存疑窦。从多纳利密码故事中，我们得知，弗朗西斯得到一条摧毁性的消息：女王询问了许多关于“莎士比亚”的问题。更确切地说，罗伯特·塞西尔先生早有觉察，并试图让女王相信，所谓莎士比亚，就是弗朗西斯·培根。
弗朗西斯随后这样写道：“听到这个消息，心底感到沉重，内心充满了恐惧与羞愧。我已经看到了自己彻底毁灭时的情形。我深深知道，如果那个叫莎士比尔的家伙真的因为害怕而挺不住的话，那他将……成为那个狡猾狐狸塞西尔的手下鱼肉。十有八九那个莎士比尔龟儿子为了自保会招供，他会说出包括《一报还一报》那种贵族题材的剧本……以及《理查二世》等剧本，均出自我手。”
上面所说《一报还一报》充满了对宗教的讽刺意味，而《理查二世》是一出近乎鼓励政治上进行反叛的危险剧本。弗朗西斯最怕有人对这两个剧本进行什么联想。因为如果大家都知道它们的真正作者是弗朗西斯的话，他担心那会“彻底摧毁我在英联邦里任何升迁的机会”。如果那样的话，那等于宣告他的事业已经结束，他的生命也应该结束了。
女王陛下后来真的发火了，虽然她总是喜欢动气。她派出了“好马快手”寻找那个叫威廉·莎士比亚的人。那些人搜查了整个剧院，河对岸的所有剧院都被彻底清查了一遍，这事发生在1597年。同时，英国枢密院下令关闭伦敦所有的剧院，因为上演了一出叫作《狗岛》的剧目。这是一出政治讽刺剧，作者被认为是托马斯·那什和本·琼森。该剧被认为“富有煽动性，充满诽谤”。我们知道，本·琼森是为培根工作，也知道培根与托马斯·那什合作写剧本，那我们完全可以断定，关闭剧院与找寻“莎士比亚”都是由于女王的疑虑和震怒所引起的。那时，所有的演员与剧作者都面临危险境地，个个噤若寒蝉。
罗伯特·塞西尔最怀疑的就是弗朗西斯。他认为，环球剧院里的演员不可能写出这样的剧本，因为他们没有这样的智慧，也不可能受到如此高的教育。他给督管斯特拉特福镇的大主教传话，要求他提供关于威廉·莎士比亚的相关资料。大主教呈递上一份关于这位“莎士比尔”的报告，但是很不令人满意，使人对大主教的个人能力大打折扣。罗伯特·塞西尔于是试探性地告诉大主教他的怀疑，他说：“那位莎士比亚大师很可能不是他本人，因为他不具备那种写作能力，也没有太多的文化。他不可能写出那么受欢迎的剧本出来……听说有几位先生都在用他的名字发表作品呢。”
罗伯特·塞西尔先生最后得出结论：“什么‘马洛’，什么‘莎士比尔’，等等，根本就没有写过什么东西出来。显然这是拿假报告来遮掩事实真相，可这谎一撒，就是好几年的光景呀。这个叫“莎士比尔”的家伙人很穷，十分木讷无趣，人又很贪婪。但他却戴着别人的面具……”
主教马上告诉罗伯特·塞西尔先生，那个叫威廉·莎士比亚的人已经不再受穷了：“他已经有万贯家财了。他们把这钱财一分为三……他自己的那一份就已经有500马克了。他给自己购置了一处非常气派的房产，叫‘新天地’……他还有一个非常漂亮的女儿，他十分疼爱她……他一心一意就想让她成为一个贵夫人，这样，也能让他沾上光，进入贵族行列。”
其实，这里说的是威廉·莎士比尔最大的女儿，她叫苏珊娜。她在性格与举止方面，非常明显地比家里的其他孩子都优秀。威廉·莎士比尔为有这样的女儿感到骄傲。他把自己的大部分财产都在遗嘱中写好，要她来继承。
主教大人建议说，我们现在最应该做的，就是抓住他，把他投进大牢，……使他枷锁缠身，再将他带到枢密院去。那样，这个混蛋就会说实话，供出谁是真正作者。
弗朗西斯此时的境况谁也不敢确定将会怎样。罗伯特·塞西尔已经找到捉拿真正作者的门路。如果威廉·莎士比尔真的把他供出来，他也没有什么办法能阻止他这么做。弗朗西斯过去曾多次从困境中脱险，全身而退。但这次恐怕是凶多吉少。
但非常奇怪的是，伊丽莎白女王保护了她的儿子。当罗伯特·塞西尔向她汇报自己的怀疑，并认为弗朗西斯可能是真正作者时，伊丽莎白却把罗伯特·塞西尔好一顿臭骂。她还连带把他已经过世的父亲老塞西尔也骂了一顿。她说他们家的人就是嫉妒，就是想方设法贬低弗朗西斯。她越说越激动，干脆动了肝火，她说他们家的人一直给弗朗西斯设置圈套。她说她压根儿就不相信，像弗朗西斯·培根这样受过良好教育又这么受人尊重的人，怎么可能与那些来自环球剧院的下层人为伍！
至于伊丽莎白是否真的不相信她的儿子写了那些剧本，我们已无从知晓。但不管当时她想的是什么，反正弗朗西斯算是躲过了一劫。他的母亲给了他一次喘息的机会，并把莎士比尔从敌人的行列中赶出去了。
伊丽莎白一世性命不保？（1）
将要临头的危险悄然消失。但只要那位威廉·莎士比尔先生一天不离开英国，弗朗西斯和他的圈子里的人就绝对不会安全。哈里·珀西，一个弗朗西斯的坚定捍卫者，很受圈子内好评的人，接受了一项任务，派他找到威廉·莎士比尔，并想办法把这个家伙弄到安全的地方去，免得再勾起女王的肝火。
珀西发现，威廉·莎士比尔就住在斯特拉特福镇一个叫作“新天地”的地方。那时，他已经病了，好像还病得不轻，看上去比实际年龄苍老许多。珀西先生很快向他说明了自己的来意，并告诉他发生了什么事情，最后跟他说，要他马上离开英国。他必须得躲一躲，直至整个事情烟消云散为止。但威廉·莎士比尔说，自己住在这里感觉很安全。他还说，万一最后被抓，到了摊牌的时候，那他把弗朗西斯供出去。他拒绝了让他离开英国的要求。他的夫人安妮则在一旁哭成了泪人，哀叹不止，一边搂住丈夫的脖子，嘴里一边不停地咕哝着。
此时此刻，惟一头脑清醒的就是他的女儿苏珊娜。她很有主意的样子，人也十分冷静。她劝父亲最好听从珀西先生的建议。父亲应该懂得，如果被发现冒用了那些剧作者的名义，不仅培根会遭遇麻烦，莎士比尔整个家族也会遭遇不幸。他们家正在逐渐增长的小金库就会一下子断了财路。更惨的是，威廉·莎士比尔先生将因此而坐牢，甚至可能还会判重罪。苏珊娜说服了父亲。珀西领着他，趁黑夜逃亡去了。究竟去了哪里？密码故事没有交代。但弗朗西斯再一次获得了安全，至少目前一段时间是安全的。
然而，在家里，还有更大的危险正等待着弗朗西斯。
让我们先回到被历史承认的一部分事实中来。这一危险涉及到埃塞克斯伯爵。在弗朗西斯看来，埃塞克斯伯爵总是惦记着要继承王位，没有比这再清楚的事情了。弗朗西斯建议他采取一种虽然困难但很圆滑的生活方式，他听不进去，而是朝困难境地大踏步地进发。弗朗西斯承认，他已经预感到灾祸即将来临。
埃塞克斯伯爵显然失宠了。有一次，他像一匹大种马那样，大声地嚼着什么东西，女王就这样放话出来：“派人把他带下去，教教他怎么做出文雅的举止。”
1596年春天，埃塞克斯伯爵等来了一次可以再次证明自己性格的机会。遭人痛恨的西班牙佬居然占领了加来港。英国人拼死拼活也不会将它拱手交到敌人手上啊。当时，谣言四起，说西班牙菲利普国王要助爱尔兰人一臂之力，与英国人抗衡。这时，女王不得不宣布开战了。埃塞克斯伯爵看到自己的机会来了，他咆哮着，恳求着，甚至恐吓着，他说，如果伊丽莎白女王不同意打击西班牙并把爱尔兰的反叛力量彻底打垮的话，那他就准备成为一个僧侣。
女王被迫对这令人绝望的局势发表讲话。她任命埃塞克斯和海军上将霍华德为联合指挥官，并命令他们不要攻击加来港，而是直取西班牙的卡迪斯港。瓦尔特·雷利爵士被任命为副总指挥官。但埃塞克斯不喜欢这个人，可能因为他很得女王宠爱吧。尽管指挥官之间充满了冲突与矛盾，但最终结果是，此次远征获得了巨大胜利。这主要得益于雷利的海上作战经验和准确的判断力。
埃塞克斯也有自己的机会，他率领部队在自己的旗帜指引下，进行了陆路进攻。他胆大而极具勇气地完成了任务。另外，他还命令部下善待俘虏，这为他在自己的部下和战败者中赢得了美名。他下命令赦免了牧师和教会人士，并要求大家尊重修女，不许劫掠。埃塞克斯做到了最好。他是在秉承骑士风格，这一切给他带来了极高的声望。那位海军上将甚至写信给国务大臣：“我可以这样告诉你，在世界上，我没有见过比伯爵更勇敢的人了。”伊丽莎白作为女人的骄傲感，无疑从内心深处被激发出来。但也只是迸发了一小会儿而已。
埃塞克斯伯爵返回英国时，作为凯旋的英雄他受到了欢迎。伦敦摆出一副历史上从未有过的阵势，士兵们骑着高头大马，沿路排开，夹道欢迎。他一路走来，得到极其热烈的掌声和人们投射过来的真诚的仰羡目光。
埃塞克斯满心期望女王会万分喜悦地迎接凯旋而归的儿子。但伊丽莎白永远都是反其道而行之，此次也不例外。没过多久，她便表现出一副冷淡的样子，对这次胜利凯旋表现出厌恶。她很快便因为此次从西班牙佬那里获取的战利品不能支付整个战役的支出，开始批评起伯爵来。此外，还有一个问题令女王不解：为什么他们连一艘从西印度返回的西班牙商船都没有截获呢？
埃塞克斯伯爵对这种冷淡深感震惊。弗朗西斯则很老到地意识到在这冷淡背后隐藏的是什么东西。年轻的埃塞克斯伯爵人长得很帅，又非常有男人味，充满英勇的气魄，此时，已经成为伊丽莎白女王的子民们崇拜的偶像了。而伊丽莎白却是个不愿意与别人分享胜利果实的女人。一个又老又累的女人是不能容忍任何竞争存在的。
弗朗西斯预计很快就会出现麻烦。将女王置于阴影之中，尤其当你还是个男人，又很年轻，背后还有军方在支持，这对于你来说是太危险了。女王心中最惧怕的就是这种飘忽不定的东西。埃塞克斯伯爵不像弗朗西斯，没能使女王感到他对王权的忠诚。女王怀疑埃塞克斯伯爵可能非常想把这个王冠戴到自己的头上。
弗朗西斯不止一次提醒埃塞克斯伯爵，希望他夹着尾巴做人，避免遭遇不测。王室里的人都知道眼前正在发生什么，他们都睁大眼睛观望事态的进一步发展。罗伯特·塞西尔则想两边都不得罪。他继续采用权宜之计，一方面催促埃塞克斯伯爵继续进行军事冒险，另一方面则作壁上观，假装对一切都不知情的样子。他希望埃塞克斯伯爵最好能战死沙场，或至少陷入国内政治及经济危机中不能自拔。只有把埃塞克斯伯爵和弗朗西斯两人除掉，塞西尔家族才能更好地掌握权力。正如法国大使所说：“如果伯爵从战场上凯旋而归，罗伯特·塞西尔就可以利用此事让女王对埃塞克斯伯爵产生猜忌，如果战败了，那正好借机把他毁掉。”
弗朗西斯和罗伯特·塞西尔都知道如何圆滑老练地在女王面前做人，而伯爵却并不这么做。当哥哥的于是给埃塞克斯伯爵写了一封长信。信中警告弟弟说，改变你的行事态度吧。你在民众面前几乎成为了偶像，最重要的一点是你还有军事家的头脑。“我不得不质问你，在一个国君的眼中，还有没有比你这种形象更危险的呢”？
弗朗西斯试图让埃塞克斯伯爵改变他在女王头脑中的印象，劝他想办法别让女王起疑心，并告诫他在女王面前，要经常说受到民众欢迎并不令自己开心，况且自己也不想获得民众这样的拥戴。弗朗西斯建议的意思大概是：如果可能的话，要想尽一切方法把自己隐藏起来，以使女王相信，伯爵最大的心愿就是让女王开心。另外，让自己沉湎于宫廷中的所有活动上面，最重要的是，将所有军事家的野心统统搁到脑后，因为女王陛下最喜欢和平。还要在女王的耳边唱颂歌，让她快乐就对了。
这是相当不错的建议。伊丽莎白王室�