纵多心爱之亲眷，尽是恶趣中枷锁，犹如岛中美罗刹，斩杀善趣刽子手。
青春美伴尽情欢，亦如贪鲜饮毒鸩，无间腐尸泥狱中，长期受苦实可悲。
可口美酒纵豪饮，成饮地狱烊水因，自处千万众生中，心难安泰如狂牛。
于此混乱世界中，愚昧贪执成苦恼，恶习染污如坏梦，昼夜胡行渡时光。
由于三毒习力猛，恶习放逸之心行，若不强制使远离，仍有大苦待自受。
有为法性为无常，浊世寿命本无待，不容无义行空过，现唯求取正心要。”
大师当年为以东柯活佛“绛央绛措”（义为文妙音海）及吉学夏仲，“敦真洛桑嘉措”（义为持教慧贤海）等许多大喇嘛为首的千百僧众，传授具足戒。此后，大师仍返扎什伦布寺，为以贡默两大喇嘛及树细阿阇黎等人为首的三藏法师三百多人，传授《金刚鬘灌顶》及《弥遮百法全部灌顶》。继应伦哲寺众的迎请，大师前去传授了密集、胜乐、能怖三种法门大灌顶，及许多护法随赐灌顶。继于丁巳年十二月内，一切智达赖云敦嘉措突然示寂。大师到拉萨供祭达赖喇嘛修圆满佛事，并主持拉萨宏愿大会。宏愿大会散会后，随即前往热振寺。在寺中闭关一月多的时间里，特迎来最有加持名“乌云玛”（义为歪头像）的阿底峡尊者像，安置供养，一心虔诚祈祷，发现许多殊胜征相。以此对阿底峡尊者作有这样的祈祷颂言：
“南无姑如曼殊廓喀雅。
弥勒法院增庄严，无数具缘无众主，虚空无垢菩萨前，请住于我心莲上。
极乐刹中无量光，佛前弟子名贤护，五明班达众中尊，阿底峡师垂慈视。
无量劫来佛世尊，为度无怙众生故，示具三学比丘相，阿底峡师垂慈视。
调伏藏地难伏魔，神通自在莲花生，尊者智慧所幻化，阿底峡师垂慈视。
难忍五浊恶世中，愚昧黑暗此北土，法光朗照作利乐，是燃灯智阿底峡。
诸佛遍主之种姓，八万四千法生处，诸圣僧伽胜导师，无欺救主阿底峡。
父师尊前诚供养，一心悲哀以祈祷，共与不共诸悉地，能速赐者阿底峡。
从今开始至菩提，若不依师莲足下，满愿依处难寻获，祈阿底峡作摄受。
难得易坏此人身，不作无义如秕弃，专为大义取心要，阿底峡前求加持。
觅除怨仇我执魔，慈爱亲属六道众，心入悲空无别道，阿底峡前求加持。
后于未来诸生中，我之苦乐与善恶，师尊怙主无不知，愿离邪途求加持。
愿我此生命终时，为见如来无量光，燃灯智师悲光照，引我往生极乐刹。
对我敬信诸人士，兜率相会我亲许，守此信约求加持，如我所约得实现。”
又作出种敦巴尊者祈祷文：
“南无姑如曼殊廓喀雅。
雪山怙主观自在，燃灯智师之长子，诸佛生源是师名，美名雅称嘉瓦仲。
十地佛子观自在，为救不净众生故，虽现梵行优婆相，心实比丘嘉瓦仲。
获得我佛所记别，优婆塞迦将出现，生于北方名法增，为藏怙主嘉瓦仲。
十方一切佛如来，所有悲智聚为一，体现噶当派宗祖，父师教主嘉瓦仲。
人寿无常冬日短，八风敌害不摇中，兹愿一心修正法，加持于我种敦杰。
衣食事故中遭损，仅为现世寿命抛，出现我爱痼疾中，加持于我种敦杰。
净修慈悲菩提心，通达无我真实性，两种道次获究竟，加持于我种敦杰。”
就这样对阿底峡两师徒，作出了如上祈祷文。此后，大师去到哲蚌寺中，哲蚌与色拉两大寺的喇嘛及僧众全体，一致请求他做哲蚌及色拉两寺的堪布。大师想到为弘宗喀法流，也就应允暂时担任两寺的堪布。那时，大师对世尊释迦牟尼作出这样的真诚祈祷文：
“南无姑如牟尼亨扎雅。
贤劫千佛星行中，毅力圆满净光灿，牟尼王佛莲足下，直至菩提我皈依。
可怖浊世火焰炽，他佛亦怯难调时，慈云悲雨解众苦，除佛释迦更有谁。
以故众多佛日光，不照难调难伏众，苦恼无怙如我辈，希救无他唯释尊。
再三思念佛日亲，未获亲见苦如焚，离消苦云望太空，泪珠不断已长倾。
以此人天佛世尊，慈颜虽逝以诚信，追踪侍佛如我辈，净饭子前祈慈恩。
佛教少分尚未修，烦恼三毒酒陶醉，无耻癫狂如我辈，愿佛慈悲作救怙。
暇满大义不取修，此生小义中空过，如抛珍宝取贱财，放逸伪者愿垂悲。
有为无常叹人寿，如露复如虚空电，仍然常筹名与利，执常推诿愿垂悲。
知敌烦恼仍紧持，三律对治知复抛，人尊如圣仍凡俗，矛盾重重愿垂悲。
不具解脱财染心，昼夜放逸沉睡客，八风之仆媚他颜，腐愚如我愿垂悲。
自昧何往导他行，自心未调作调他，自身未解作众宰，僧相如我愿垂悲。
如是佛徒之行传，与自他行作念缘，于此哲蚌大寺中，比丘慧贤法幢述。”
在那时和其他一些时间中，由于大师见著破戒僧人虽是无耻地受用信施，仍然遭受贫困，发生许多苦恼，以此心生悲痛。而以此类推到他所见：仅为此生快乐，则心行两方面都作尽一切罪恶。当这些因缘浮现在他的心中时，他作出了这样的圣洁语言：
“南无姑如曼殊廓喀雅。
至尊上师前敬礼，祈师赐听广慈察，小义利事何必作，欲求安乐唯佛业。
聚积财物如秋云，亲眷来往如商客，青春肉体犹虹彩，具智友辈思此否？
暇满人身如晨星，死主不待逼近来，死后途中险处多，具智友辈思此否？
轮回处如毒蛇窟，五欲受用毒树果，梵释福德空如蕉，具智友辈思此否？
危时救者是三宝，最终常伴有恩师，须益己时唯正法，具智友辈思此否？
遥远路粮布施库，增上道梯为戒律，形体美严由忍辱，具智友辈思此否？
此生安乐不值贪，兜率胜越此土乐，天味鲜胜此间食，具智友辈思此否？
天衣胜超世衣暖，宝饰超此世庄严，天及天女胜世友，具智友辈思此否？
人间欲乐何必贪，天身受用本现有，追求世间乐难得，如理修法乐自生！”
那时，大师甚愿去到寂静处修行心要，于是作出表达心愿的语言：
“南无姑如曼殊廓喀雅。
诸佛智慧体，无匹慧贤称，请住我心中，祈赐二悉地。
可怕轮回狱，生老病死轮，祈师慈悲力，除业烦恼生。
青春发育苗，年月转渐熟，心稚身已老，思此内心忧。
夏原花烂漫，美观可悦心，转瞬至秋时，凋谢境伤神。
如是悦意美，青春意生骄，壮去老至时，内已血气衰。
外皮枯下垂，皱纹覆满面，身体弯如弓，齿冠半脱落，唇动不美观，语钝显口吃，
沫溅如洒水，起立须挣持，坐下等跌倒，腿弱难载体，摇摆身战栗，发已变斑白。
眼昏珠内陷，耳聋语音塞，智暗忆力薄，身虽依墙堡，
移步须暂支，命将近死时，亲眷仆等愿，此老死方安。
老衰青春逝，如木心腐朽，如是可怖苦，非经一二次，屡屡不断受。
老相常如是，众虽皆不免，青春少年辈，常盼青春住。
心恋金色秽，迅即现丑容，空中五彩虹，虽美速即逝。
以故身健时，于此藏乐园，研习声明学，阅昔诸德史。
多闻法思义，一心住禅乐，后得观如幻，暂时游诸国。
从共道次第，直至双运位，合于一座间，昼夜勤薰修。
后虽过壮年，如佛牟尼说：多闻彼比丘，年虽过青春，悦意妙林薮，于中能安住。
不畏老死苦，心断世八法，喜修师净行，静地如天苑。
上有浮云盖，中悬雾如氅，翠树为下裳，花草满野圃，鸟兽为友伴。
心安乐如舞，此生贪嗔境，怨亲名亦无，增乐藏土中，
远离荣枯苦，养生知足味，守持七圣财。
作何能自主，随诸佛后学，如是胜安乐，帝释亦难获。
以故乎加额，对美如意海，如凫眼远望，心念静地乐。
烦恼鲸屡害，生老病死浪，无边轮回海，速脱趣静地。
修习福与慧，断生老病死，愿身受用等，成佛果永恒。
如是诸愿望，祈师与三宝，息灾赐顺缘，迅速得成就。”
那时，古格法王再三迎请大师，大师应请从拉萨回扎什伦布寺中住约半月随即上道，沿途接受所有各寺信众承事供养，并满众愿广施法雨。至四月二十三日抵无能胜湖边，大师在湖边作沐浴并拾得湖中石子一握，大多现有佛像。第二天来到大雪山前面时，雪山顶上出现五彩虹霓，状如幢、幡、伞盖、悬彩等相，为数无量。大师对此山顶异境发生喜爱留恋，由于这是大师来到此间，始发现此种可爱奇观，大雪山区驻守官枳空多正及其眷属等，都说他们来到雪山区已有十年之久，今天才见到这样奇观瑞相。他们对大师发生敬信，如仆人般尾随大师到侠那扎贡，得谒见大师请求加持，虔诚祝愿说：“我从此直至菩提，恳师摄受。”
继于五月十三日，夏仲法王及觉窝达波寺院及地方为首诸人，率同许多马队与群众前来迎接，当大师行抵相熊地区所属朗巴顶地方时，诸天人供散雨花等瑞相，为众目所共睹。十五日在脱顶金殿寺由夏仲法王迎请大师安住于大译师仁清桑波的座上，供养大宝曼遮，并对僧伽聚会大海供养放衬，以及请求传授上师瑜伽等法要。大师在寺中驻锡，对檀越等传授密集、胜乐、能怖三法灌顶，以及生圆二次第、那塘百法、文殊法门、噶当派教法史等。总之，以古格王昆仲叔侄等为首的僧伽大众都生起无量敬信，对大师承事供养。继于九月十三日，大师由古格起程返藏，檀越头人等送至大雪山。大师徒步绕行雪山，即于雪山前展开极大的僧俗大会，午时大师对大会群众作普遍的灌顶时，观见大雪山呈现蓝色如吠琉璃，各种庄严。遂问身边一些僧人看见大雪山是何状态？左右答说：“是洁白光亮的。”复问喀纳却哲看见何状？答说：“是极蓝的。”对仅只看到这样的任何一种形色都叹为稀有。
大师于十一月十三日到达扎什伦布大寺，对僧众放茶散衬。岁时，拉萨及哲蚌的山后，已有数以万计的人在战争中被杀害，色拉及哲蚌两寺正遭捣毁。虽是如往昔释迦世尊住世时，迦毗罗卫城人与憍萨罗国人的大战，以及印藏佛教所发生的各种兴衰事件那样，系业已成熟，难以挽救。但是大师一心以佛教为念，仍然在色拉及哲蚌两寺中，放茶散衬达五次之多，并施喀什米尔精美供水瓶各一套。又在哲蚌弥勒殿及银塔殿中，供上好七只一套的大供水碗各一套。一切的努力都是为使色、哲两寺不致衰颓而做。到了当年的秋末，蒙古军大队已到达藏北，藏政府执政王臣等发来公文，命令大师必须前来前藏。当大师起身前往拉萨的晚间，梦见同大众共诵名“却勒玛”（义为现前妙善）的宗喀巴大师修悟诫言，大师醒来心生欢喜认为和约有可达成的希望，以此大师一直行抵绒波荡，但是仍未能如愿。于是大师暂住哲蚌寺中，对色、哲两寺，广作财法二施来扶持使僧众生命不致断绝。特别是兵祸中所作最坏的事件，是对达赖喇嘛索朗嘉措的肉身银塔的塔门装饰完全毁掉，大师为使佛教长久住世的缘起，特以黄金、松耳石等珍宝来重新培修，并以达赖喇嘛少壮时物品装饰塔门成极庄严。又于色、哲两寺释迦佛像前各供吉祥哈达的幡络一套。并于三寺中多次供施僧众茶饮，之后也就在哲蚌寺中暂时闭关。
继于七月初间，藏军齐集江塘贡，到了十一日上午茶饮方毕时，顷刻间传来蒙古军马队已跑到噶脱，被杀的人已有千数的消息。大师听获此讯后，即时结束闭关，不顾生命危险，徒步赶快来到敦坝；也就在藏军扎营甲坡山界间，蒙古骑兵第二次开始冲锋的枪林弹雨之中，大师去到拉准藏王（固始汗）之前送上隆重的礼品，殷重地请求息兵。拉准藏王也尊重大师所说，停止骑兵进攻，以此成千上万的官兵生命，得到解救。那时，蒙藏两方都在拉萨誓约并作供养，将统理事宜交与大师，于是大师对双方先发神召牌召集双方，在大昭寺供奉释迦佛像金殿光辉所照之处，郑重发誓不再犯干戈。就这样大师不顾生命危险拯救了色、哲两寺，而使宗喀巴大师教脉不绝得到继续住持下去。想到这些事件因缘，无怪在洛桑却季绛称出世以后，所有住持宗喀巴大师贤善宗风的善巧正直贤士大德，都一致称扬洛桑却季绛称对文殊宗喀圣教来说，是与宗喀巴大师的恩德相媲美的。
那时，由于有情共业及罪恶魔力，总对佛教，特别宗喀圣教的发展发生了极大灾障，以致达赖喇嘛云敦嘉措突然示寂。在寻识转世活佛灵童都发生极大困难的时候，幸赖洛桑却季绛称大师以大量财物，使北部雪山地区的粗恶诸人都获得饱满。对所有发生的战乱都本无亲爱疏憎的平等心，及猛利的慈悲心力从中调和，使双方均消除仇恨，而达成和约。大师解救了许多罪大恶极者的性命，并对这类罪恶粗重的人说业果法门调伏其心。这样大师完全没有为著自利，总为西藏人民一切有情获得安宁，以及僧伽寺院在无乱事的环境中能获得法行增长，特为能寻识达赖喇嘛转世活佛真正灵童的一种方便。大师不顾自己生命危险，作了极大努力，始于壬戌年觅识到达赖喇嘛转世活佛灵童，由诞生地琼杰迎到哲蚌寺中。剃度后，取名为昂旺洛桑嘉措（义为语自在慧贤海，即五世达赖）。渐次大师为做传授沙弥戒的亲教师，令达赖喇嘛受沙弥戒。并先为达赖喇嘛传授长寿灌顶，继传能怖金刚大灌顶及许多护法的随缘灌顶等无量法要。爱护达赖喇嘛如如意大宝而加以培育。
此后于癸亥年，拉萨幻化寺中，因具有五种自然现出圣大悲观音像的殿顶已极腐坏，将有倒塌的危险，大师心中不忍而发心重新修建。关于这一事项大师亲口这样说：“五种自然现出观音圣像的殿顶金已脱尽，因此右边遭到浸蚀，解体散落，木料已腐，殿顶有极大的下塌危险。但是这一神殿十分严厉，喇嘛导师及俗官等谁也不敢去拆动改修。我为圣观自在服役之故，愿舍生命，从根木拆卸来新修，用了好几百驮铜和上千两黄金，才将金殿新修完竣，幸未发生丝毫灾障，经六月之久精造完工，作了开光法事。我想这样做法，培植了西藏共同�