自作主张，偷偷将一些蛋、奶油和肉食送到他们家，结果切重罚了这个“自作聪明的家伙”。 他完全不讲究吃，什么时候饿得受不了了，就胡乱弄点东西下肚。被格瓦拉特意请来为工业部领导讲授经济知识的拉韦涅就曾开玩笑地说：“我们什么都不怕，就怕切请客，那简直是一场灾难，只有米饭和面糊糊，连调味品都没有，他倒能吃得津津有味。”一些人于是将格瓦拉与耶稣相提并论，只是，格瓦拉显得更有人情味，虽然有些严厉，可他从来不把自己当成什么领导。下属博雷戈回忆说：“有一次，我弄到了一辆崭新的美洲豹小汽车。它原来的主人是烟草联合企业的老板，他本人从古巴逃走了，车也就不要了。我觉得这辆车开起来特别帅，就这么开了一星期时间。结果被切发现了，他对我大叫说：‘这是拉皮条的人开的车，我们是为人民工作的人，怎么能开这种车！给你两小时，赶紧从这辆车上给我滚下来！’我立刻下了车，结果他又让人给我送了辆雪佛莱，车型跟他的一模一样。这种车在古巴也就是中档车吧。之后我开了它整整10年。”
格瓦拉像机器一样，几乎不眠不休地工作着，在工业部一次全体大会上，他就说过，他从没上过一次夜总会，没看过一场电影，没去过一次海滩，几乎没有睡过一次好觉。他自我解嘲说，比起在座的很多人，他其实是个土包子，“我不知道人民如何生活，我只知道数字、符号、图表。”即便如此，古巴的情况还是一团糟。为了摆脱被美国操纵经济的命运，古巴开始大规模减少砂糖产量，一半的甘蔗田被烧毁，改建炼油、炼钢、发电、水泥这些重工业。格瓦拉坚持实行严格的中央集权制，每个企业都在政府计划下进行生产，结果便是各行各业各自为政，繁文缛节多得令人窒息。1963年的一项调查报告显示，有些农场进行一项生产计划，需要经过20多个行政部门的批准。
1961年8月5日，乌拉圭的埃斯特角举行“争取进步联盟大会”。格瓦拉代表古巴出席大会，他没有想到，在机场时他竟然受到了那么多人的热烈欢迎，可是由于当时哮喘病发作，他只是向大家挥了挥手，便匆匆离去。
在会上，美国代表向拉美各国开出支票，每年提供10亿美元，另外还有望以私人名义投资10亿美元，可谓是“项庄舞剑，意在沛公”。格瓦拉看出其用心，立刻忘记自己还在生病，站起来滔滔不绝地做了两个小时发言，他说：“这次大会是政治性的会议，因为大会的宗旨就是反对古巴在美洲大陆所树立的榜样。”他声明，“如果美国要侵略古巴，哈瓦那的男女老少必定会奋起抵抗‘扬基佬’。”结果大会以11票对9票，否决了孤立古巴的提案。
格瓦拉的出现，令乌拉圭的进步人士兴奋不已，他在这个邻国的地位，竟然如同一个最耀眼的明星，各大报章都不断在显要位置刊登他的照片，报告他每一天的行程和讲话。8月17日，格瓦拉来到蒙德维迪亚大学演讲，结果狂热的大学生高喊“古巴万岁”，他的出现甚至引发左右两派学生混战，一位教授不幸中弹，当场身亡。
8月17日晚上，格瓦拉还会见了智利未来的总统阿连德，两人在一起吃了顿简单的晚餐。格瓦拉跟他虽然见面次数不多，却是心意相通的好友，见面时格瓦拉打趣说：“我们待会儿得分头走，万一有人要使些下三滥的暗杀把戏，我们还不至于死在一起。”阿连德回忆说：“我认识许多领导人，但只有两个人给我的印象最深，这两人是切和周恩来。他们的身上都有一种内在的力量，他们都有坚定不移的信念，都有风趣幽默的性格。每当我与切交谈，还未等他开口，我已经知道他要说什么。从他的眼神里，我常常可以看到温柔与孤独。”
卡斯特罗始终不肯承认，在这次导弹事件中，古巴终究还是赢家，至少他们得到了美国的保证，可以在一段时间内全心全意投入经济建设。
格瓦拉倒是一直与苏联人有接触，可惜，他始终对他们没什么好印象。1960年11月，他第一次访问苏联，一再请苏联领导人帮助古巴建立炼钢厂，这是他们工业化最迫切需要的基础工业。可是赫鲁晓夫却一味搪塞，借口古巴没有煤炭、生铁，也没有技术人员，再说炼出来钢铁，在古巴也没什么用。格瓦拉解释说，技术人员可以训练出来，生铁、煤炭可以从墨西哥进口，可是赫鲁晓夫含糊其辞，最后还是没有答应。这件事令他对苏联人怀有戒心。一次他去苏联一位官员家里做客，那位官员拿出从法国进口的最上等瓷器餐具来招待格瓦拉，结果，整整一顿饭，格瓦拉的脸上都挂着冷笑。吃罢饭，他转身对主人说：“真是讽刺，我这个土包子怎么配使用这么高级的餐具？”
与官员家中的豪华派场形成鲜明对比的，是苏联老百姓的生活环境。在格瓦拉看来，莫斯科这地方还没哈瓦那先进。一次他哮喘病犯得很厉害，只好在家休息，他的朋友帕迪拉来看他，准备跟他讲述自己出访苏联的感受。格瓦拉生硬地打断了他，说：“老兄，咱们说点别的吧。我早就知道了，苏联那地方是个狗窝，不用你说，我亲眼看见了。”
第五部分：工业部长阁下工业部长阁下（5）
苏联人同样不喜欢古巴。赫鲁晓夫说过，古巴那群人都是些疯子，居然敢在美国人眼皮底下玩火，搞不好就会触发世界大战。因此，他始终安排眼线去古巴，不时汇报这群疯子的动态。克格勃出身的亚历山大·阿历克谢夫被赫鲁晓夫以记者的身份派往哈瓦那，不久出任大使馆一等秘书。
1962年5月，亚历山大·阿历克谢夫被召回国，被通知说即将派他出任驻古巴大使。5月 底，赫鲁晓夫召见他，在场的还有国防部长马林诺夫斯基和米高扬等人。赫鲁晓夫问他：“阿历克谢夫同志，为了拯救古巴革命，我们准备把导弹运到古巴去，你认为如何，卡斯特罗会不会接受？”阿历克谢夫吓了一跳，立刻就回答说，这种想法不大现实，以他对古巴的了解，卡斯特罗的革命就是为了摆脱外国的控制，他们已经把美国军事顾问给赶跑了，怎么可能还会接受苏联的导弹保护？听后，赫鲁晓夫很是不爽，马林诺夫斯基立刻将阿历克谢夫狠狠骂了一通。
阿历克谢夫不得不带着苏联“农业代表团”到哈瓦那赴任，代表团里有一个农业工程师，其实是苏联的导弹司令。谈判竟然进行得极其顺利，格瓦拉表示，只要是为了捍卫古巴独立，任何代价都不在乎。
8月27日，格瓦拉前去莫斯科进行进一步会谈，苏联提出要全面控制在古巴的导弹部队、军港和机场。格瓦拉坚决反对，强调双方合作的前提是古巴独立自主，导弹基地必须受古巴武装部队的指挥，同时要求将条约进一步公开。赫鲁晓夫勃然大怒，指着格瓦拉的鼻子说：“格瓦拉同志，你的名字‘Che’在我们亚美尼亚语中，就是‘不’的意思。好吧，切，请你走吧。我们之间的合作一笔勾销，责任完全在你！”
格瓦拉不紧不慢地收拾文件，拿起公文包转身就要走人。米高扬急忙上前拉住他。这次会谈，官方并没有出任何公报。9月6日，格瓦拉回到哈瓦那时，苏联的导弹已经开始在古巴的土地上部署。
一切都逃不过美国人的眼睛。10月14日，美国的安德森少校驾驶U…2侦察机，拍回了一组照片。照片清楚地显示出，古巴的圣安德鲁斯已经安装了苏联的导弹发射装置，这里刚好位于佛罗里达对面。导弹似乎尚未安装核弹头，但美国人紧张地意识到，核弹头可以随时安装上去。
肯尼迪权衡了数日，照会了北约和美洲国家组织后，10月22日，他在电视上宣布了自以为最合适的对策：全面封锁，禁止一切载有攻击性军事装备的船只靠近古巴。他向国民解释说，古巴拥有如此大规模的攻击性武器，已经成为一个可怕的战略基地，这将给所有美洲人的安全构成极大威胁。英国和法国站在了美国一边，敦促苏联尽快将导弹和部队撤出古巴，很多人认为核战争已经一触即发。
格瓦拉的第一反应，是准备打仗。10月22日晚上，在得知美国的孤立政策后，他立刻赶回工业部自己的办公室，摘下挂在墙上的药袋，背上装满子弹的冲锋枪，匆匆跳上吉普车，赶往距导弹基地最近的瓜内镇。随后，他挑选了6000名士兵，要他们自行解决武器和交通工具，准时开赴战场。10月27日，美国人的一架U…2侦察机被击落，飞行员就是发现古巴导弹装置的安德森。
关于这架侦察机是由谁击落的，到现在还众说纷纭。有人认为是苏联的地对空导弹击落的，也有人相信是格瓦拉击落的。甚至还有一种更传奇的说法，说是那天卡斯特罗前去基地，看到雷达上正在显示侦察机飞越古巴领空的航线，他于是问旁边的人：“导弹怎么才能把飞机打下来？”有人就指了指导弹发射按钮。于是卡斯特罗下意识地按下按钮，大家还没反应过来，导弹已经将侦察机准确无误地击落。
在古巴已经进入战斗状态的时候，苏联人还在与美国谈判。10月26日，赫鲁晓夫提出和解条件：美国人保证绝不侵犯古巴，那么苏联就在联合国观察员的监督下，把导弹撤走。10月28日，美苏双方正式达成妥协。
卡斯特罗和格瓦拉认为苏联老大哥背信弃义，一心想要发动核战争的卡斯特罗从广播中听到这一消息后，气得一拳把房间里的镜子打碎，还砸烂了自己的一副眼镜。格瓦拉则立刻下令切断与苏联部队联络的电话线。
第五部分：工业部长阁下工业部长阁下（6）
卡斯特罗坚决拒绝联合国稽查小组到古巴，倒霉的米高扬奉命前去安抚古巴人。卡斯特罗拒绝见米高扬，让他等了整整10天，结果连妻子去世都没办法赶回去见最后一面。卡斯特罗始终不肯承认，在这次导弹事件中，古巴还是赢家。客观地说，他们因此而得到了美国的保证，可以在一段时间内全心全意投入经济建设。
“零度点”训练基地，集结了来自委内瑞拉、尼加拉瓜、秘鲁等国的青年战士，格瓦拉是这里的负责人，他不仅向战士们传授战争知识，讲授游击战战术，更向年轻人讲解马克思主义。
受古巴影响，南美的革命形势如暗潮般涌动。1961年10月，格瓦拉的危地马拉同志胡里奥·卡西莱斯悄悄离开古巴，回到家乡继续打游击。临走时，格瓦拉向卡西莱斯传授自己的经验，总结为三个要诀：经常转移、绝对怀疑、持久警惕。经常转移：游击战的要义就在于绝不能在同一个地点停留超过两夜，要不断从一个地方转移到另一个地方；绝对怀疑：不能小觑斗争的复杂性，不要相信身边的任何人，除非已经牢牢控制了一个解放区；持久警惕：不能在屋子里睡觉，以免被敌人包围，昼伏夜出，加强巡逻。可惜，在1962年3月，格瓦拉就听到了卡西莱斯阵亡的噩耗。
无论如何，革命的种子已经在危地马拉生根发芽。3月至4月，人民的反政府运动风起云涌，大学及中学停课，首都交通瘫痪，革命行动联合会将各种革命力量组织在一起。当年12月，游击队成立了一支统一的起义军。拉丁美洲游击战的序幕渐渐展开。这正是格瓦拉所期待的，他相信南美各国本身就是血脉相连的兄弟，此时应该展开“洲际革命”，以此来打破美国的统治，各国通过武装斗争获得真正的独立自主。 离哈瓦那不远处，出现了一个叫“零度点”的神秘训练基地。这里集结了来自委内瑞拉、尼加拉瓜、秘鲁等各国的青年战士，分成36个营区接受分批训练，而格瓦拉正是这里的负责人。他不仅向战士们传授战争知识，讲授游击战战术，更向年轻人讲解马克思主义。有趣的是，格瓦拉前妻伊尔达的弟弟里卡多也在其中，高中毕业后，他来到哈瓦那读经济学，参加过击退猪湾侵略者的战斗。
第五部分：工业部长阁下卡斯特罗对切不耐烦了
古巴导弹危机过去半年，卡斯特罗的气终于消下去了。1963年4月26日，卡斯特罗前往莫斯科，赫鲁晓夫颁发给他一面金星列宁勋章，而且以极其热情的语言歌颂卡斯特罗，“普罗米修斯把永恒之火传给了人类。你，为了自由而战的勇士，把十月革命的圣火传到了西半球。”除此之外，赫鲁晓夫还给了卡斯特罗相当实惠的好处：苏联政府保证向古巴提供1500辆拖拉机和3500辆收割机，而且答应以国际市场上的最高价收购古巴砂糖。 卡斯特罗已经忘记当年他是如何咒骂苏联人的了。回国后，他重新将甘蔗种植放在第一位，这样，格瓦拉领导的工业部将不再是国家的关键部门。格瓦拉非常不赞同卡斯特罗这种极端近视的做法，私下里他对人抱怨说，一个农业的古巴，一个再次成为“世界糖王”的古巴，将可能会导致社会主义的覆灭。古巴付出了沉重的代价，才取得了今天难能可贵的自由，如果将经济命脉交到苏联手上，成了“苏联的女儿”，那与当年将“宗主权”交给美国又有什么分别？
在南美革命这一问题上，格瓦拉与卡斯特罗的意见也出现了严重分歧。卡斯特罗并不十分热衷于继续搞革命，在他看来，也许“零度点”训练基地存在的惟一价值就是牵制美国人。1964年7月，在接受《纽约时报》记者理查德·埃德尔采访时，他就公开表示：只要美国停止敌视古巴，古巴就会终止援助拉美的革命运动。
格瓦拉的意见则截然不同。1963年委内瑞拉政府发现了一批苏联和捷克制武器，后来查实是由古巴提供的。所有人都相信，这些武器就是由格瓦拉帮助运到委内瑞拉的，格瓦拉也没有否认。他还在几次会议中不断强调：美洲各国人民解放的道路，都必须经历枪林弹雨的考验，古巴革命已经�