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于是，魏公公以皇帝中旨的名义，重新起用崔呈秀为御史，销除对他的贪污指控。
从此开始，魏公公对朝中异已力量大规模的消除屠杀，正始进入了执行阶段。
魏忠贤的果于诛戮
杀人，即使是手握天下大柄的魏公公杀人，也是要有借口的。所以，打造某个案件，铸成大案，可以把诸人皆牵涉进去，以图一网打尽。如何下手呢，正好朝中有熊廷弼案，虽然牵连很勉强，但套子是现成的，于是阉党们经过细心谋划，开始了行动。
熊廷弼案当时又称“辽案”。天启初年，熊廷弼以兵部尚书兼右副都御史的身份经略辽东，与广宁巡抚王化贞不和，造成明军在与后金（满清）军队作战中惨败，二人先后被逮，问成死罪。毕竟为官多年，辽东大败的主要责任不在已身，熊廷弼设法找到时为内阁中书的汪文言，让他帮忙暗地疏通关节，救自己一命。
汪文言此人在《明史》中无单传，在列传一百三十二中合于杨涟等人传中，附于魏大中传后。汪文言非进士出身，由县吏起家，为人侠气有智，有纵横之才，早先以监生身份入京，曾用计破朝中齐、楚、浙三党，是个老于政治谋划并能在朝中救人捞人的资深政治掮客。由于知道汪文言与帅爷王安关系特好，魏忠贤杀掉王安后就剥夺其当时监生的身份，并一度把他收监。汪文言大能人，未几通过关节出狱，凭借昔日名声广游于朝官之间，终日车马盈门。首辅叶向高很欣赏汪文言才智，起用他为内阁中书。有了这种身份，他得以与赵南星、杨涟、左光斗、魏大中等东林派正人交游密切。
汪文言为搭救熊廷弼，四处打通关节，最后七拐八绕，竟与魏忠贤搭上桥，让大公公出手相救。魏公公本人与熊廷弼没有直接的过节和深仇大恨，派人捎口信，说只要拿出四万两白银，熊廷弼会马上得以释放。经过好几个“中间人”，可能银子数目最后到达熊家时成了十万两，家里凑不齐这么多银子，熊家只能哭穷表示拿不起。
这事，如果放在别的贪官身上，拿人钱财与人消灾，不见银子不出手，也就罢了。老魏公公心狭，听说熊尚书这么一个大官连这点银子都舍不得出，非常生气。不久，他又打听到自己老对头汪文言替熊廷弼四处活动，灵感突现，决定以熊案为突破口，把朝中与自己作对的诸位带头人一网打尽。
先行一步，阉党的大理寺丞徐大化率先劾奏杨涟、左光斗“党同伐异”、招权纳贿。魏忠贤矫诏，先把二人抓起来。很快，汪文言被逮入狱。
主审此案的阉党许显纯、田尔耕等人捏造罪名，把御史周宗建、黄尊素等四人削籍。
阉党工部主事曹钦程出面，劾奏赵南星、高攀龙、黄尊素、魏大中等人收受贿赂。
崔呈秀急不可耐，向魏公公呈献《天鉴》、《同志》两部名单录，把叶向高列为东林党之首，《同志》列陈宗器等词林部院卿寺等大臣，登名造册，以供阉党抓人有依有据。阉党王绍微又献《点将录》，这个目录更是鲜活形象，以水浒一百单八将为蓝本，其“首领”为“天罡星”三十六人，托塔天王李三才、及时雨叶向高、浪子钱谦益、圣手书生文震孟、大刀杨涟、智多星缪昌期等；又有“地煞星”七十二人，包括神机军帅顾大章、旱地忽律游大任等。魏公公听人念这个，高兴得手舞足蹈。昔日在市井为无赖时，魏忠贤最爱听水浒、三国，如今有这么一个“点将录”，他不能不为之开颜。
可笑的是，魏忠贤拿王绍徽《点将录》给明熹宗看，这小伙子看见“托塔天王”四字，不知何解，他没听过《水浒》说书，自然不知这些绰号由来。魏公公来了精神，给皇帝大讲特讲起《水浒传》中“托塔天王”晁盖等人智劫“生辰钢”的故事。皇帝越听越入神，大叫“托塔天王真是神勇有智！”这一来，论事离题，怕皇帝对现实名录中的“托塔天王”东林党人等大臣产生联想的好感，魏忠贤此后再也不给天启帝《点将录》看。（史家研究，《点将录》很可能是阉党阮大铖代作，这位戏曲大家擅长此种东西，他自己上献魏公公《百官图》，更形象地以画图方式来教魏忠贤按部就班杀人。）
汪文言为人是条刚烈汉子，在狱中两个多月受尽常人想象不到的刑讯，至死不攀诬诸大臣。主审阉党许显纯力逼他指称杨涟受熊廷弼之贿，汪文言仰天大呼：“哎！世上岂有贪赃的杨大洪，天下人谁信！”大洪，乃杨涟别号。
汪文言不承认也不要紧，许显纯自己撰写“供词”，然后抓住已经被打死的汪文言手指往案卷上“按手印”。
天启五月（1625年）秋，杨涟、左光斗、周朝瑞、顾大章等先前劾奏魏忠贤最力的言官即被逮捕入北镇抚司。阉党许显纯备极楚毒，严刑拷掠诸人。
杨涟等人坚持不认罪。其间，左光斗对同牢的人说：“阉党杀我辈有两法，乘我等不服罪，严刑致我们死地；其二，在狱中暗害我们，慢慢报称我们是病死。不如我们现在先行认罪，执送法司，或可免于立死。”诸人觉得有理，就暂时承认受贿的罪名。
坏人的卑鄙和阴险，超出一般君子人的想象力。阉党早有心理准备，左光斗等人承认“受贿”，正好给了他们“追比”的机会。所谓“追比”，又称“杖比”，即犯人每次受杖刑，均定出下一次交出贿银的日期，到时候交不出，又会再以大杖伺侯。一般是每五日一比，犯人只能被迫说出下一次交银日期。只要吐不出所承的受贿银两数目，就会五日一刑，无休止折磨下去。
身为朝臣武夫，阉学锦衣卫帮凶许显纯阴毒如蝎，他叱命昔日的这些同僚叠跪阶前，剥去衣服，裸体反接，戴枷受刑。杖打之后，又处以夹刑，日夜拷掠，惨毒无比。打了十多天，诸人已经连跪都跪不住。均身荷百余斤大木枷葡伏于地受杖。
于是，二十多天后，先前首疏魏忠贤二十四大罪的杨涟先被拷掠死。死时土囊压身，两只大铁钉贯耳，惨状让人不忍卒睹；紧接着，魏大中被打死，尸体溃烂，筋骨皆碎；接着，左光斗、周朝瑞等人相继被残杀。“辽案”主犯熊廷弼也被押入闹市，公开问斩。熊廷弼被杀前肯定纳闷，怎么有这么多东林“同志”陪绑被杀？前些年熊廷弼在朝中当御史时，性刚好骂，专门与姚宗文等人排斥东林党人，他与这些东林党根本就不是“同路人”。其后，阉党当廷杖死熊廷弼姻亲、御史吴裕中。对于被害诸臣家属，魏阉党人仍不放过，继续严刑求比。
根据吴应箕《熹朝忠节死臣列传》统计，死于魏忠贤阉党之手的，最早是被杖死的万燝；汪文言一案左光斗、杨涟等六人惨死；阉党李实诬奏致死的有周顺昌、高攀龙、李应升等七人；以逆党罪逮入狱中拷掠至死的有王元相 等十六人；刘铎之因作诗嘲讽魏忠贤被杀于市；苏继欧等七人得罪阉党被缢死；赵南星在戌所被折磨死。每弄死一个大臣，阉党许显纯就会剔取死者喉骨装入一小盒内，在封识上写清死者姓名，送交魏忠贤为验信。
紧接着，阉党疯狂在朝廷进行“大清除”，把不附于已的尚书李宗延、张问达以及侍郎公鼐等五十多正、副部级官员削逐出廷，朝暑一空。吏部尚书赵南星被遣送振武卫劳改，并累死在戌所。赵南星与阉党魏广微父亲还是好友，他再入朝后待小魏以子侄辈之礼，激起魏广微私恨，竟致父亲老友于死地。
在窜逐异已的同时，魏忠贤遍植私人党羽于要津，所以，当时的朝廷，实为魏忠贤朝廷，他本人获得明熹宗赐印，文曰“顾命元臣”。客氏也有赐印，文曰“钦赐奉圣夫人”。大家甭以为这两块印最大不过是玉玺大小。不对，每块印用黄金铸成，重三百两。巨大金印，以老魏魁梧的体格，他自己都拿不起这块大金印。
明熹宗根本不知外朝之事，终日家人欢会一般与客氏、魏忠贤游玩。一次，皇帝本人在西苑湖面与两个小宦官划船玩，边玩边与岸上敞坐饮酒的魏、客二人笑乐招呼。忽然一阵风起，小船翻覆，明熹宗摔入水中。魏忠贤、客氏相顾错愕，不知如何是好。幸亏明熹宗会几下狗刨，扑腾上岸。两个小宦者旱鸭子，沉入水底淹死。这次很悬，明熹宗差点步昔日正德皇帝后尘。
气焰熏张，热火烹油，魏忠贤借助东厂特务机关，横行肆意，破家败户，凡是被他们盯上的，三族九宗，均顿成齑粉。一般官员百姓自不必讲，连宁安大长公主儿子李承恩这样的皇亲，由于魏公公贪图他家中御赐器物，便诬其偷盗宫中御物，逮起来弄死，然后把财物抄收后全部运入自己宅中。
同时，魏公公拔苗助长，竭力培植自己家族势力，以其侄魏良卿为佥书锦衣卫，掌南镇抚司事；以其侄魏希孟为锦衣同知，控制锦衣卫；以其族叔魏志德其外甥傅之琮、冯继先为都督佥事，掌御林军；内廷太监方面，王体乾、李朝钦等三十余人对他“热烈拥护”；外廷方面，文臣有崔呈秀、田吉、吴淳夫、李夔龙、倪文焕云出坏主意，外号“五虎”；武臣有田尔耕、许显纯、崔应元、孙云鹤、杨寰等负责杀人清除异已，号“五彪”；又有吏部尚书周应秋等人管“组织人事”，号“十狗”；又有“十孩儿”、“四十孙”等名号，不可数计。自内阁、六部至四方总督巡抚，魏忠贤皆遍布死党，内外大权，一归于魏忠贤一人之手。
其间好笑的是，阉党太仆少卿曹钦程与诸人关系不睦，被削籍为民，排挤出朝。老曹辞行，到魏忠贤面前哭辞：“君臣之义已绝，父子之恩难忘！”魏公公心中厌恶此人，迎头一口大浓痰，老曹狼狈踉跄而去。魏忠贤败后，曹钦程被下狱论死，关在牢中好多年，其家人不送饭给他。老曹天天抢夺其他同牢囚犯的伙食，终日醉饱。李自成攻破北京，曹钦程破狱投降，最后随闯贼败走，不知所终。
为了进一步打击东林党人，魏忠贤又让阉党阁臣顾秉谦总裁，会修《三朝要典》，详细记述“红丸案”、“梃击案”、“移宫案”，想把“三案”颠倒黑白，铸成铁案。
天启六年，锦衣卫去苏州逮捕吏部主事周顺昌时，由于缇骑霸横，周顺昌民望又好，市民颜佩韦等人率众勇为，打死缇骑特务三人，几乎酿成一次大的民变。当然，最后周顺昌以及要救他的颜佩韦等五烈人皆被杀。中学课本中的《五人墓碑记》，详细地记载了这件事情的始末。其实，此类民变也是一个苗头，说明明王朝的统治，确有日薄西山之感。基层百姓心中的怨恨，皆入火山内的融浆一样，蓄势待发。
一改以前太监上疏自称“奴婢”的称呼，魏忠贤自称“臣”；一改以前宦者称皇帝为“万岁爷”，魏忠贤改称“皇上”、“陛下”，把自己这种没老二的公公等同于外廷大臣。而且，此时的魏忠贤，已经被宫内宦官们称为“九千岁”，只要是逢他生日，“千岁、千岁、千千岁”之声，轰响若雷，在禁宫中经久回荡。外廷大臣更有无耻者，拜见魏公公时称谀他为“九千九百岁”，比皇帝只差“一百岁”。
为了宣示威仪，每次外出，魏忠贤均乘坐华丽异常的羽幢青盖文轩车，四匹如龙骏马拉引，周遭握刀骑卫锦衣卫列侍，加上优伶、百戏、厨传，下人等杂役人等，随从万人左右。魏公公喜爱大戏一样的排场，途中饶鼓雷鸣，敲敲打打，吹吹奏奏，烟尘避天，旗帜匝地，道旁行人总误会是天子驾到。
魏公公老姘头客氏当仁不让。每次出行，盛服靓妆，几十岁的老娘们描眉涂眼，打粉打腮，有太监王朝忠等数十人皆腰缠红玉带作前驱，随从甚盛。她还常常在禁宫内坐乘马车四处游逛，到乾清宫圣驾休息处也从不下车，太上奶奶一样。客氏很喜在晚夜出宫回私宅，灯炬彻地，照如白昼。其马车四周，数百宫女着穿华美宫衣，各提灯笼，远望俨然似仙女下凡，簇拥客氏马车。私宅大门中开之后，自管事到家仆，上千人挨次叩头，齐叫“老祖太太千岁、千岁、千千岁”，喧声震天。
为了进一步尊崇魏忠贤，满朝文武和内廷太监，皆不敢直呼其名，只称其为“厂臣”。阁臣以皇帝名义拟票，开口闭口是“朕与厂臣”，即在官方正式文件中，魏公公与当今天子肩挨肩呆着。
天启六年夏，浙江巡抚潘汝桢开头，以机户感恩的名义，在当地为魏忠贤建“生祠”，即活人纪念馆，地点位于关羽庙和岳飞庙之间。他上疏谀赞魏公公“心勤体国，念切恤民”。疏上，圣旨称道，赐名“普德”。由此一来，天下阿谀官员群起效仿，魏公公生祠遍天下，祠坊均属“奉旨”而建，额题都是“广恩”、“永恩”、“崇德”、“崇仁”、“报恩”一类的上嘉好名。而一祠所费，少则数万，多则数十上百万，均从公库支出，外加刮剑民财。
生祠建筑，各地林木也大遭殃，多被砍供以作修祠木料。吴淳夫等人所建生祠规模巨大，九进殿庭，肃穆如太庙，壮丽如帝居。仅占地一项，就拆毁民房数万间。大同、湖广、蓟州等地的生祠中，魏忠贤座像皆系纯金制成，头戴冲天寇，手执玉笏，俨如上天尊帝一个派头。由于巧匠众多，江南一带的魏忠贤祠内座像多以沉香木为体，眼耳口鼻手足皆栩栩如生，晴能顾盼，口欲发声，连坐像肚子中也按真实比例用金玉珠宝雕成肠子肚子心肝肺腰子大油和杂碎，充斥其中，以拟真人。
魏忠贤的雕像外饰以华丽彩仪，髻上留一孔，以供每日一换时令鲜花插上。一次，由于一间祠内坐像的头部雕凿稍大，朝廷派来赐冠的小宦官手拿真珍黄金宝冠往头上按了半天按不下去。工匠惶恐，见尺寸稍稍差一点，便抡起斧子剔削像头两下，把宝冠放稳。小宦者亲见“亲爹”脑袋挨削，痛在心头，抱像头大哭，责骂工匠不止。……
宦者如此，官员们更甚。山东巡抚李精白上建祠疏时有“尧天之巍荡”之语奉承魏公公，特意把“巍”字上的山字头放在下面，并派人转告魏公公：“我怕