规定格鲁派寺院常往僧人数量时，哲蚌寺额定为7700人。到1951年前，实际住寺僧人多达万余人，成为西藏地区规模最大，僧人最多的寺院集团。哲蚌寺主要由措钦大殿、四大扎仓（即罗赛林扎仓、德阳扎仓、阿巴扎仓、郭芒扎仓）和甘丹颇章几部分组成。措钦大殿位于哲蚌寺中心，占地面积将近4500平方米，殿前有一石铺广场，登上17级宽广的石阶，便是8根列柱的明廊。大殿内的经堂规模宏大，装饰华丽，五光十色。经堂面积约1800平方米，总共有183根柱子。大殿内的造像，不论正殿或厢殿，都极为生动。特别是大殿中间的文殊菩萨及白伞盖像，高大而精致。
大殿侧室的两座银塔，分别为三世达（叉）赖和四世达（叉）赖喇嘛的灵塔。大殿后部的堆松拉康为哲蚌寺最早的拉康（拉康意为神殿或庙堂）之一，绛央曲结曾在此净室内修行。现供三世达（叉）赖及各自之随身二弟子。堆松拉康左右两侧分别是弥旺拉康和伦本拉康。大展二楼设甘珠尔拉康，藏《甘珠尔》经。三楼是强巴通垂佛殿，内供强巴佛八岁时的等身巨形铜像。强巴佛殿门上悬挂“穆隆元善”汉文匾额一方，是清朝时任驻藏大臣的琦善在他任满调离西藏时（1846年）刻制奉献的。大殿四楼是释迦佛殿，据说是以500两银子制成，两旁置银塔13座。扎仓是格鲁派寺院的学经单位，也是措钦以下的管理机构。哲蚌寺建成初期有七个扎仓，分别由绛央曲结的七大弟子主持，后来各地来寺的僧人不断增多，根据他们的学经内容和籍贯合并成现在的罗赛林、郭芒、德阳和阿巴四大扎仓。后一个为密宗扎仓。
甘丹颇章为极乐宫，建于1530年，由二世达（叉）赖喇嘛根敦嘉措任哲蚌寺第十任赤巴（住持）时主持修建。以后三世、四世、五世达（叉）赖喇嘛都在这里居住过并历任该寺赤巴。五世达（叉）赖喇嘛时期，建立了强有力的地方政权，因政务在该颇章（颇章意为宫殿）处理，故名甘丹颇章政权，甘丹颇章遂一度成为西藏地区政治权力中心，后来五世达（叉）赖迁往布达拉宫处理政务。
哲蚌寺建筑结构严密，殿宇相接、群楼层叠，每个建筑单位基本上分为三个地平层次，即落院、经堂和佛殿，形成由大门到佛殿逐层升高的格局，强调和突出了佛殿的尊贵地位。其中规模宏大、雄奇庄严的措钦大殿，错落有致；不拘一格的德阳扎仓，粗厚古朴；布局严密的阿马巴扎仓，高耸森严；富丽常皇的甘丹颇章等都是西藏大型建筑的代表。在建筑外部又采用金顶、法（叉）轮、宝幢、八宝等佛教题材加以装饰，增强了佛教的庄严气氛，使建筑整体上显得更加宏伟壮观。
哲蚌寺的法事颇多，每逢大型佛教纪念日和藏历每月的望晦日（即十五日、三十日）等吉日，都要举行相应的法事。还有一些僧俗同庆的活动，其中场面最大的要算“哲蚌雪顿”了。“雪顿”藏语意为“酸奶宴”，原先是一种纯宗教活动。按照佛教的法规戒律，夏天有几十天禁止倍人出门的“夏居居”，直到解制为止。在开禁之日，世俗百姓以酸奶施舍。后来“雪顿”的内容更加丰富，宗教活动和文娱活动相结合，规模不断扩大。藏历六月三十日“雪顿节”当天，先是以哲蚌寺为中心，清晨展览巨幅佛像唐卡画，接着举行藏戏会演，实为僧俗同乐的乐节日。
哲蚌寺收藏有数有万计的文物古籍。各殿所供不同时期的许多塑像均神态生动、结构严谨，代表了西藏雕塑工艺的极高水平，各殿的壁画色彩艳丽，线条有力。此外寺内还珍藏有佛教经典《甘珠尔》和佛经注疏《甘珠尔》各100多部，以及宗喀巴三师徒等著述的几百部佛教经典手抄本。所有这些都是藏族人民勤劳智慧的结晶，对于研究西藏历史、宗教、艺术等学科，具有十分重要的价值。
寺院占地面积约25万平方米，规模宏大。寺内原有七大札仓（经学院），后合并为洛色林、果莽、德扬、阿巴四大札仓，西藏众多的名僧大都曾在此学经，最盛时有僧众近万人，是喇嘛教最大的寺院。现在寺内的主要建筑有措钦大殿、洛色林札仓、葛丹颇章、甲央拉康等，大都是明清两代陆续修建的。寺院的主要建筑大经堂雄伟壮观，有183根立柱，柱上的雕刻十分精美，还有精美的织绣经幢、挂幢、唐卡（卷轴画）以及佛像、壁画等加以修饰，同时可以容纳八千人诵经。寺内还保存有大量藏族的古代文献和经籍。
由大门看去，建于后面的供殿轮廓逐步升高，殿宇相接，群楼耸峙，规模宏大。
从哲蚌寺沿西侧的台阶拾级而上，进一个大门后的左侧是一条小路，旁边流水潺潺，经常会有一些藏族妇女在溪边洗铃铛。走上一个山间的小平台，可以俯瞰山谷的景色。继续往上走，左边远处有绘在山石上的佛像，后面的铁架子就是雪顿节时的晒佛台。每年雪顿节哲蚌寺都会举行晒佛仪式，在山坡上展示一幅巨型佛像唐卡，引来大批信徒和游客前来祷福，场面十分壮观。著名的甘丹颇章就在右边一处有很高台阶的地方。甘丹颇章大门前面有一个小佛殿，里面供奉着五世达（叉）赖喇嘛的衣服。甘丹颇章有3层，每个窗口都种了许多花。这里曾是二至五世达（叉）赖喇嘛居住的地方。后来五世达（叉）赖喇嘛掌管地方政权，在布达拉宫完成白宫部分重建后，便正式迁到了布达拉宫。由于达（叉）赖是在甘丹颇章建立政权的，所以史称”甘丹颇章王朝”。
甘丹寺颇章的西北侧是措钦大殿。
措钦大殿（“措钦”意为大@法堂）是哲蚌寺的主要建筑。大殿中间的大文殊像及白伞盖像极为精致。这里供有哲蚌寺的主要信仰物——右旋法螺。这是哲蚌寺在破土新建时，宗喀巴从“廓布山法库”掘出的一只法螺，赠予弟子扎西班丹，预祝他建寺圆满成功，并以此为基地，弘扬佛法，广建寺庙。弟子扎西班丹把它尊为佛祖所赐的寺宝，珍藏在寺内。大殿后面是扎西斑丹当年修行的净室。
措钦大殿里还保存有二到四世达（叉）赖喇嘛的灵塔。大殿四壁，绘有许多精彩壁画，有释迦牟尼的百行转图、人间形成图、生死轮回图等。措钦大殿东边有一个半地下的很小的山洞，只能容一个人进入，名叫“让迥玛”。它原来是宗喀巴关静修的地方，也是哲蚌寺最早的建筑。大殿3层是强巴佛（未来佛）殿。这尊强巴佛像是当年宗喀巴在世的时候由他亲自开光的，极为著名，亦名“强巴通真”。除了宗教的意义以外，它是西藏所有强巴佛里最通神的一尊，强巴佛殿再往上就是用金轮、宝幢装饰的大殿的金顶。
哲蚌寺里的僧人很友善，都非常乐意給游客担任向导。老浪和一个18、9岁的小喇嘛聊天，开玩笑似地问：“寺里边的活佛有没有算命的？”小和尚手拿佛珠：“我们这里不叫‘算命’，叫‘历算’。”
“怎么叫‘立算’？是站着算吗？”
小和尚笑了笑：“不是站立的立，是年历的历！”
老浪问：“怎么讲？”
小和尚一开口就滔滔不绝：
“恰白·次旦平措等所著《西藏通史》一书有记载：在藏族历史上出现过无数位精通显密经论中的内明学、因明学等大小五明学的贤哲，在这里不要说介绍每个人的简况，就连名字也难以一一列出。这里我们向大家介绍一位近代著名的藏医历算大师钦绕罗布。
钦绕罗布于公元1883年藏历十五饶迥水羊年出生在西藏雅隆之中心泽当甲萨庙附近，其父为历算家，名叫孜巴俄乌坚，母亲名叫央金。他在父母的恩养下长至七八岁时，到泽当俄曲扎仓出家ｗωｗ奇Qìsuu書còm网。由于天生聪慧加上个人的勤奋，他的背诵经书等学业成绩比其他同龄僧侣优异，当寺院选送个别优等生到药王山藏医学校时，钦绕罗布被选中，得到了在拉萨药王山藏医学校学习的机会。钦绕罗布来到药王山后，先从师药王山扎仓之藏医色拉寺德庆林药师阿旺曲丹习医书，在此期间正如格言昕云“欲安乐抛开求学之念，要求学问应舍弃安乐之欲；安安乐乐怎能获取学问，求学之路无安乐可言”那样，他抛开一切安乐之念，夜以继日地一心扑在学习上，对于吃穿方面从不讲究，坚持清贫的僧侣生活，甚至穿烂的袈裟打成结再穿用，据说因此其他僧人送给他一个绰号叫结巴。由于他年复一年地勤奋刻苦学习，顺利地通过了背熟医书、背诵礼赞等考试科目。因为学习成绩优秀，他成为达（叉）赖喇嘛的正保健医生俄希·强巴土旺从第二届藏医学校学生中选收的3名学生作为特别培养对象其中的一员。此后，他在达（叉）赖保健医生、藏医学家确来白丹的指导下，熟读了《四部医典》及其注释《蓝琉璃》等医书精典，并通过实践彻底领悟其要点，另外他又拜了藏医多吉杰参·强白如白罗卓、锡金活佛乌金丹增嘉措、枯努活佛丹曾坚参、晋美赤来活佛、札日晋甲承嗣等各派精通五明的智者为师，如饥似渴地学习藏医、天文历法，星命数法、藏文文法、语言学、涛镜论等。特别在听保健医生堪布俄希·多吉坚赞、锡金活佛乌金等导师授课那段时间里，珍惜每秒时间，坚持加倍努力，每天中午随便买几块饼子，然后坐在室外吃饭并稍作休息，之后又一心扑在学习上，根本不顾及其他，每次考好了一门主要科目之后才去拉萨市内的春月饭馆饱餐一顿，如果所学科目稍有背不熟，或答对导师提问时稍有差错就滴水不进，并惩罚自己日夜温习功课。他之所以最后成为精通藏医历法、兼通其他文化的高僧大德，是与他的勤奋努力、完成学业、力图学用结合分不开的。
公元1910（藏历铁狗）年，钦绕罗布年满28岁时，被药王山藏医学校委任为哲蚌寺药师，期间医治许多僧俗病人，业绩显著。此时他亦开始了研究医典，撰写新的医学著作。《钦绕罗布传略》中记载说：“从医学角度显示的《人体线条月亮宝镜》一书结尾中说，‘藏历第十五饶迥铁狗年，本人年方29岁，担任了哲蚌寺药师，期间到泽当康村南边的藏医室居住两个多月，认真研究医典注解《蓝琉璃》等医典，撰写医典新著，研究中如发现对一些词意有新的理解就打上记号，加以旁注，并面呈多吉坚参恩师，按照导师的指点进行准确的修订。’此时他先后撰写有具德根本医典的释解《医学海洋之要点》、《草药标本希贵金穗》、《婴儿接生法益民月镜》等著作。”钦绕罗布在年轻时代就博览医学群书，造福于民众，他就像曾未有过的宝石，发出灿烂的光芒，带绐人民康健的生活，真是一位可歌可敬的医学家。
藏历第十五饶迥火龙（1916）年，十三世达（*）赖喇嘛签署创办‘集藏医教学、诊治疾病、配制药物、推算藏历、兼学文化于一体的利众藏医历算学校’时，特别委任钦绕罗布大师为孜仲列参，兼任药王山藏医历算学校院长及导师和药王山曼巴扎仓之导师。这个藏医历算学校的‘主要任务是为各寺院培养藏医历算人才的同时推算年历，为群众门诊，向96个宗谿提供儿科常识，婴儿接生常识，推算婴儿生辰星宿等。’从那时开始他承担起讲授藏医历算典籍、实践中指点传授、辨认草药、配制药方等项任务。为了事业他不分昼夜，勤奋不止，创新校规和严格的考试办法．培养了许多合格藏医人才，他们遍布全藏区，推动了医学事业的发展。此时钦绕罗布还兼任药王山利众吠陀林寺主持，在这12年间全面负责该扎仓的内外事务。推动该寺严守戒规，在教学、经济等方面做了很大努力。特别值得一提的是历史上该扎仑收藏的81幅彩色挂图（第悉桑结嘉措时期绘制）因借用未还等原因，除31幅以外，其余全部遗失。他按达（*）赖的旨意，于水猪（1923）年，重新绘制彩色挂图，以填补遗失空缺部分，使这幅直观形象教学模具能够完整地保存至今。他的名声和业绩传扬各地以后，前来拜师求学者无数，他不仅从西藏各寺院、藏军部队招收僧俗学徒，还从青海、阿坝、康区招收学子，甚至从不丹、锡金、克什米尔、库伦等地招进学生，所培养的弟子和再传弟子达千人。这些弟子以藏医历算为主，兼学正字法、诗镜、文法、语言等适合自己的科目，成为雪域藏医历算的顶梁柱。
钦绕罗布大师取得很高的学术地位之后，还如饥似渴地求学深造，先后拜古洛活佛降白瑞白罗卓、参尼活佛降白罗布，哲蚌寺康萨活佛、帕崩卡德庆宁布、拉尊活佛、降央钦孜旺布、佐庆白追活佛等各教派的练达学者为师，学习《四部医典》、时轮，宇妥之医学要旨等，从容他曲仓·罗桑当曲嘉措处学习《白琉璃》正副本中的流年算命、合婚五行算、死丧卜算、元音数术注释，学习十执历中时轮进位率、《声律学·宝生论》、从蒙古格西嘎丹乃丹处学习《妙音声明释）等，广泛涉足群书，以解除疑团。
藏历土马（1918）年十三世达（叉）赖喇嘛特别器重地委任钦绕罗布为私人副保健医生。木牛（1925）年药王山寺院的一些不明事理的执事和个别僧人借用钦绕罗布脾气暴躁一事向布达拉宫秘书机构诬告他，致使被停止一切职务。钦绕罗布免去药王山扎仓之主持职务后，仍担任着达（叉）赖喇嘛的保健医生，时间长达15年之久，可是藏历水猴（1932）年不知何故突然被革去了保健医生之职，此后藏历水鸡（1933）年，至尊达（叉）赖似患感冒，不久便谢世。保健医生强巴因给达（叉）赖服用药的问题遭到惩处，而钦绕罗布大师因1年前就被罢免了保健医生职务，而没有牵连进这件事，能够继续参与开办藏医历算学校。据说他领悟到十三达（叉）赖喇嘛为什么要那样对待自己的意图时，更激起了对达（叉）赖喇嘛的信仰之情，并把自己当时的感受常常告诉学生。
热振当政期间，钦绕罗布被提升为地方政府的堪穷，对藏医历算学校学生实行新的薪水制。藏历火鸡（1957）年他又被十四世达（叉）赖喇嘛封为侍从达尔罕大堪布。西藏民主改革以后的1961（�