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从现代生理解剖学来看，“泥丸”正是大脑下部的中心部位。称之为“间脑”。间脑分三部分：有背侧丘脑（又称“丘脑”）、后丘脑和下丘脑。其中的背侧丘脑（丘脑）是大脑皮质下的一个高级感觉中枢。来自全身的深、浅感觉都是先到此处中继之后，才投射到大脑皮质的。
泥丸宫正是脑神经的中枢。其中的“脑垂体”更是中心的中心。脑垂体位于蝶骨的一个四陷处，它在体内是保护最严密的一个器官。过去认为神经学和内分泌学是两个不同的学科。最近几十年的科学研究，才确认了神经系统和内分泌系统是相互关联，不可分离的。因此才称为“神经内分泌学”。
脑垂体是一个受中枢神经系统控制的一个人体最关键的内分泌器官，它分泌有十种不同的激素，这些激素分别凋控全身的其他内分泌器官。如甲状腺、胸腺、肾上腺、性腺…等。身体的所有部位都受脑垂体的调节影响。当然，现在人体科学对神经内分泌的很多机理还是一个不解之迷。
总而言之，泥丸、神室、气海、丹田是内丹术的四大关窍。丹经中对关窍的繁多名称，都是这四大关窍的别称。明确掌握了这四大关窍，修炼内丹术就不会走入岐途。《心法》的指点，可谓天机洩尽了。
现在不妨从生理解剖学的观点，来设想一下四大关窍的方位，以供参考。
四大关窍的体内横线部位，上文已有所指。泥丸为两眉间的印堂穴，神室为紫宫穴，气海为膻中穴，丹田为神阔穴。因此再由体内上下设想一条垂直线，两线的交点就是关窍的方位。有些文章中，认为从头顶的“百会穴”到“会阴穴”引一条垂直线。笔者认为，“百会穴”在头部的稍后，这一垂线在体中也稍后，不符“前七，后三”的比例。笔者认为由“囱会穴”引线至“会阴穴”为好。“囱会”是人生中的一个重要部位。婴儿在出生后，“囱会”是顶骨未合缝的地方，出生后一年半左右才封闭。四大关窍的设想方位如图二。
“丹田”在内丹术中也是关窍的一个泛称，故有上、中、下之分。关窍的泛称还有“玄关”和“玄扎”。《仙佛合宗》说：“玄关是至玄至妙之机关”，“非是以一窍着形象而言。”又说“事事法法皆有一些儿玄妙在。”《老子》说：“谷神不死，是为玄庀”。谷（空虚）神（道）是产生万物的总根源，“玄庀”和丹田一样具有生化的功用。
但是丹经中又有“玄关一窍”和“玄扎之门”之称，笔者认为，这就不是泛称，而是有
具体所指了。这个具体所指的关窍，就是四大关窍中的“丹田”。《老子》说：“玄札之门，是谓天地根，绵绵若存，用之不勤”。可以理解为是说：意守丹田，守中、守一，是修
炼的要诀。
最后，再垂复几句。四大关窍的方位既定，但是它们均在体内，是看不见，摸不着 的。必须用意念、意想、真意才能感知它们的存在。《老子》说：“惚兮恍兮，其中有象， 恍兮惚兮，其中有物；窈兮冥兮，其中有精”《心法·安炉》说；要“安审端详，与心相 印”。“无形无象，有象有形，即空是色，究竟难寻”。又说“着色空琴终是假”，“想来 似有看时无”，只有在虚极静笃时，才能“静观动察证如如”。