且结合开示应成的正见之规，对安立世俗相的情况等开示了作详细考察的原本，而且开示了密宗和显教的共与不共道的区别，并对吉祥密集的圆满次第五次第之体性（本质）、次第、数目决定等的不共要义，极巧妙地结合起来作了开示。宗喀巴大师有时向本尊启请说：“仍有不懂之处。”本尊说：“勿忘这些教言，从笔记中可以得知。尤其是应在与本尊无别的上师近前，祈求加持，并闭关念修，努力地做积福与净障，而且对于经论的教义，应以理智详察细思，将此三者结合进行实修。勿轻易地认为已经满足，当延长时间不断地善作考察。待到时机已至，由于我（文殊）现在给你播下了这些种子作为增上缘，你将会迅速地获得善妙的通达。”由于宗喀巴大师对于圣龙树父子宗规的《中观》和密集金刚法类有极大的求知愿望，因此他向本尊问道：“探寻这些法类，在西藏的上师中，以谁为最善？”本尊说：“没有比仁达哇更为善巧的。但是他仍不能最后完全解决你所希求的全圆知识，还是由乌玛巴作译师，由我对你讲说，这是最好的。然而乌玛巴必须尽快前往多康地区。因此现在不作讲说，你作避世修行者，到寂静之地，按照以上所说三者结合实修，并善为努力地修养各种所缘法门，不久你将会通达这诸种教义。”此外，关于教法之甚深要义，应依何种典籍而作研讨，本尊也对他作了广大的指示，并且开示说，在印度的诸善巧班智达，也有一些著作，不可认为完全无误。这种例外，仅是少许。宗喀巴大师又问：“那末，解释圣龙树密意的著作，是否可以认为阿阇黎月称的著作是完全无误的？”本尊说：“月称系在上方世界佛土中一位如来的身前观察智力最胜的一位菩萨。他为了阐明圣龙树的教法心要，依誓愿而降生于此土。因此他所释的圣龙树的密意，不管是在密宗或显教任何阶段中，都是没有丝毫错误的。因此你对他的著作应当随时随地坚持认为是唯一可以信依的。”那时，乌玛巴向文殊启问宗喀巴大师的历代前后转生的情况。文殊回答说：“这详见于以前所说关于他前后转生的广大悬记的记事之中。”那时，宗喀巴大师对于略作讲说和闻法的事业，也极有兴趣。喇嘛乌玛巴的心中也对大师的意向表示同意。于是乌玛巴向至尊文殊请求说：“对于这样年轻而有极大智慧的宗喀巴来说，如果仍然作讲说和闻法的事业，显然对教法会带来极大的利益。况且能如此大兴讲说和闻法事业的人停下来去作避世修行，我（乌玛巴）也将遭受到众人的责难。因此请许可他暂时仍作讲说和闻法。”至尊文殊说：“对教法与有情，何者能有利益，你不能知。对于责难，你就容忍吧！若不在寂静地进行修持，他的寿命将不会长久（指宗喀巴），仅能有一些相似（不真）的利益。因此还是去作避世修行最为合适。”依据这些指示，宗喀巴大师就寻求密宗法类的各种修习，迅速寻得后，不久即决心前去修行。如此这般的不共通的稀有传记，仅见于一切智克珠杰所写的附录中。而未记入普遍传称的广传。其中的原因是：那时，这类情况一切智宗喀巴大师仅对一二个具缘者示说过，极为保密。他不喜欢公开地向大众宣说，因而未列入广传中。不仅如此，所有不可思议的稀有秘密史事，都必须获得宗喀巴大师的亲自开许才能笔之于书。除此而外其他人如一切智克珠杰也必须按照宗喀巴大师的旨意来记之于书。他未开许者，则在（克珠杰所作）密传中所记录。其中也这样说：“不共通的身语意的无上秘密史事，最胜智者们也难以计其数量，仅对具缘者略说少许。获得允许示说诸事，我（克珠杰）仅就心中所知的一些，于此讲说。”所以纵然是能笔之于书的那些秘密史事，一切智克珠杰也仅对一些具誓（戒）者宣说，除此未见有普遍流传之事。后期虽有对一切智宗喀巴大师持不恭敬态度的人，也只不过是一些偏私的不正思想者而已。其他宗派的一切无偏私的人士，无不将宗喀巴大师作为顶饰而真实崇敬。所以衮噶德勒仁钦（意为普庆吉祥宝）为了能使普遍的尊卑人众增长信仰而写作的《宗喀巴大师》传中，将克珠杰所作密传中的诸种述说与正文一起撰出。与此相同的其它传记中，也随其所适应的事迹，作了显明的记载。尤其是绛央却杰扎喜伯丹（意为文殊法王吉祥具德）所著《宗喀巴大师密传》中的那些祈祷颂词，现在色拉、哲蚌、甘丹三大寺为表率的所有中央和边远地区的日窝格鲁派的一切大小寺庙，无不在僧会中常作讽诵。另外在拉萨大愿法会中，在不分宗派的成千上万的僧俗大众集会中，也讽诵此颂词。因此我（著者）所作的这一广传中，也将密传中的诸史事，分初、中、后三种事业，依照时间先后结合正文一起撰写出来。由于想到要使本书能成为后世应化有情增长信解的因素，并能有益于一切智宗喀巴大师的教法，这或许不成为泄密的罪过，因而撰写出来。祈愿一切智宗喀巴师徒给予护持，使如是（著作）不成为罪过。
此后宗喀巴大师暂时在乌玛巴的近前，听受教法。为了求学密宗方面的教法，他希望去到年楚河上游（今江孜地区）德钦巴·却吉伯哇（意为法吉样）的近前求学。由于那时听到帕木竹巴的大军将返回后藏的消息，在军事尚未解决的那一个秋季里，大师驻锡绒区的仁隆普寺。等到秋末才去到年楚河上游的贡松德钦，与—切智布顿大师的徒众中最精于《时轮》法类并富有密宗经教和无数传统修法及教授秘诀等才智的却吉伯哇大师相会。在会面的当天晚上，宗喀巴大师的近侍以黄绸一匹供献给却吉伯哇大师。在第二天献问安茶饭，同时供献鹦哥绿上等缎一匹，请求讲授《时轮广释支分》等法。那时却吉伯哇大师已讲完《时轮广释》第一品。因此却吉伯哇大师说道：“缘起甚善！昨天供的黄绸符合地界收摄次第（黄色表地界），由此看来，将会很好完成圆满次第。今晨所供的绿缎是表空界（绿色表空界），与生起次第符合，由此看来，将会圆满完成生起次第。尤其是刚好讲到第二品之首，当说‘为成熟诸大人’句义的时候，这又是最为妙善的缘起。因此当圆满讲授此一法类。”于是十分喜悦地应允讲授此一教法。这是对宗喀巴大师指示的悬记，暗示宗喀巴大师能将所有时轮内、外、他三种要义完全领会于心中，而且如密续中所说的那样所有生圆二次第的修悟功德，也能圆满地生起于心中。于是从第二品之首开始起讲，继后再从第一品之首起，重讲一遍。宗喀巴大师在那里从秋季起一直住到第二年春季法会之前，听受了续释的讲解、作法指导、瑜伽六支的修法指南等全圆教授。此后宗喀巴大师意欲听受所有瑜伽（部）的经教讲解，但希望在这之前，练习瑜伽的传统修法。于是迎请夏鲁寺中昔日布顿大师的主要“却约”（即主管供祀的侍徒）、最精于瑜伽传统修法的瑜伽师泽旺的弟子扎巴和瑜伽师贡桑前来，大师与他们—起住在年楚河上下游交界处的泽扎康寺中，熟练地学习了金刚界和吉祥最胜顶等所有瑜伽部大曼荼罗（坛城）绘画弹线、舞姿、音调、曼陀罗仪轨的汇编、挽结手印等法。有一天晚间，大师在梦中，见一高大座位上，坐有一位年老的喇嘛，头戴佛冠，手持铃杵，说是名叫穹波特巴。大师也坐在他的前面，那老喇嘛起而以金刚步的步法右绕宗喀巴大师三匝，从珠鬘发出“唉嘎巴积嘎巴”的咒音，他手持铃杵置于大师的头顶上说，命名“噶玛班遮”。说后仍坐于座上。至尊宗喀巴梦醒后思考，以前自己的密号为顿月多杰（意为不空金刚），而“噶玛班遮”（意为羯摩金刚）也相同于不空成就这一种性之名。
继后，宗喀巴大师又来到德钦寺，从春末起经过夏季直住到秋初，在却吉伯哇的大师近前，听受了金刚鬘的灌顶经教指导解说，以及舞姿、弹线、音调三者传统作法的教导。对于金刚鬘三法门，精研而成为善巧。此外还听受了薄伽梵金刚手大轮的灌顶经教、教授秘诀等许多深广的教法。此后宗喀巴大师想去到夏鲁寺穹波特巴的近前，听受瑜伽部法类。有一天晚间，梦中见一高座上，有一老年喇嘛以自然善妙的姿态坐着，说是名叫仁波且穹波哇。宗喀巴大师自己也坐于喇嘛的座前。喇嘛用两手解开衣服，出示胸间，命大师观看，大师看见喇嘛的胸间有长行咒鬘围绕多层而成为咒轮，咒字晃耀，对所有咒文都念了一遍。宗喀巴大师说，后来他和喇嘛会面时喇嘛的身相与梦中所见的一般无二。这样的梦兆第一是说：喇嘛将金刚乘四部密续的所有灌顶甘露完全交付与宗喀巴大师，命名为噶玛班遮，此预示大师将成为大宏佛教事业的主宰。梦兆的后段，表示因作如是灌顶次第，已成熟了大师的身心。喇嘛自己胸间的咒轮是对宗喀巴大师明显地指示，（喇嘛穹波哇）自己的心中拥有怎样的金刚乘的经教和修行教授、经教诵授和所有现证功德等。并悬记宗喀巴大师拥有如所明示的那样的一切功德。宗喀巴大师的心中完全领会的，都将会成为现实。这确是特殊的象征啊！果如梦中所见那样，不久宗喀巴大师去到夏鲁寺，从那年的秋末起经冬季及第二年的春夏两季，在持密大师金刚持（对大师的尊称）穹波特巴的座前，听受了以瑜伽部诸大曼荼罗为表率的诸下部密续（指除无上瑜伽部的以下三部密续）部的经教，即现在西藏所有的清净灌顶法流从未中断的全圆教授，并听受了薄伽梵胜乐轮鲁哼巴和纳波巴的传规等无上大密的无数经教。总的说来，喇嘛穹波特巴所拥有的金刚乘经教和教授秘诀，如瓶泻水，全倾于大师，宗喀巴大师尽量听受后，完全充满于心中。那时，宗喀巴大师以会供轮及经常承事服役等供养喇嘛穹波特巴，而使喇嘛心生喜悦！其诚信之钩，使得众人心生感动。当时，至尊穹波特巴每传一种灌顶至结尾时，他无论如何都要开示说：“此法由某某上师极为喜悦地传授给我。”后来一切智宗喀巴大师也开示说：“密法一切悉地（成就）的主要根本，唯一依赖于上师心生喜悦。因此，传授灌顶的一切时间中，应是上师正生喜悦时，随其传授。”显然这种说法，是有其所指的。在圆满传授完如是诸经教时，喇嘛穹波特巴说：“现在法已交付法主，以此我无可懊悔！”以上是表示梦兆的余义等也获得圆满完成。
昔日一切智布顿大师和喇嘛穹波巴二人在衮钦·帕窝巴（意为遍智圣光）的座前，在同一会供轮供会的行列中，听受衮钦大师讲说吉祥密集及瑜伽等各种大曼荼罗的灌顶时，衮钦大师说：“至尊玛尔巴所说，太阳出现立大柱［10］若译其含义，即是说：‘太阳出现立大柱’这句话，是对你穹波修士说的吧。”这故事也是在那时传说的。这是显然意识到至尊穹波特巴从衮钦帕窝巴和一切智布顿两师求得加大海般的密法教导，其全未退失加持力的金刚乘全圆教法，交付于至尊宗喀巴大师的手中，因此成为此土中一切众生的利乐之本而说的。如是，宗喀巴大师从至尊穹波特巴座前想要听受的诸经教，都获得圆满成功之后，他再次去到驻锡白朗（今日喀则专区白朗县）帕巴日山中的喇嘛德钦·却吉伯哇的近前，听受了《金刚心要释》、《金刚手上集释》、《那若法门广释》以及许多时轮支分的教法，并听受了布顿大师所著的两种传规的《密集》经教解说等许多教法。之后，宗喀巴大师前往德钦寺，他迎请帕巴日寺中精通夏鲁派［11］瑜伽法类的大德法师坚赞扎巴前来校正瑜伽部法类的舞姿和音调等传统作法，并且在法师的近前，听受了各种适宜助教法，尤其是听受了布顿大师所著《金刚生起广释》、《瑜伽根本续摄义》、《释续金刚顶》、《吉祥最胜》、《净治恶趣续》等，以及《现见自性》、《果夏那庄严续》、《古祥最胜广释》等续及释续和无量的印度经典著作的经文诵授，而成为富有如大海般的金刚乘教法的大师。
正如克珠·玛微尼玛的著述中说：
“明咒经典大海中，
四灌顶浪起汹涌，
二次如涛现变化，（“二次”指生起次第和圆满次第）
成就俱胝宝藏丰。”
又说：
“多闻具足千慧眼，
福寿才智饰辫端，
胜乘甘露权统者，（“胜乘”即金刚乘或说密乘）
愿成佛教主尊严。”
宗喀巴大师对于密续经典，不管是印度的论著或西藏的著述，都不是只学习少部分或片面的，而是对所有的经典，经过细研和决疑加以熟习精通。如以下三部密续部［12］为例来说，宗喀巴大师在自著论述中说：
“不知下三续部道，
以此无上瑜伽续，
虽是诸续中最妙，
仅有立誓无他道。（不知下三部则对无上瑜伽仅有立誓之言而已）
见此总续与善成，（见此理已对总续与妙善成就续）
妙臂问经、禅后续，
三种事部总与别，
久习诸续熟教要。”
又说：
“第二续部诸行部，
毗卢现证为主尊，
净治身心行续精，（主要净治身心为行续部之精要）
所有皆如此决定。（所有行部决定是以净治身心为主）
第三续部瑜伽部，
主要吉祥续集续，（主要为吉样密续和自性集续）
释续金刚顶熟习，
瑜伽部宴得欢庆。”（熟习以上诸密续，则可欢庆瑜伽部法宴美满）
如上所说，表明宗喀巴大师对于《秘密总续》、《妙善成就密续》、《妙臂问经》、《禅定后续》、《妙吉祥根本续》、《最胜明慧续》、《金刚手威猛续》、《摧坏金刚续》、《毗卢现证》、《吉祥最胜》、《吉祥最胜释》、《果夏那庄严续》、《根本续自性集续》、《释续金刚顶》、《金刚界》等许多下部密续经典的要义，以及各别的曼荼罗、灌顶修法、舞姿、有相和无相瑜伽的作业及其补充部分，各不相